Senkuu telah menetapkan tujuannya untuk mengembalikan dua juta tahun pencapaian manusia dan menghidupkan kembali semua orang yang telah menjadi patung. Namun, ada satu orang yang menghalanginya: Tsukasa Shishiou, yang percaya bahwa hanya yang terkuat di antara mereka yang terpetifikasi yang seharusnya dihidupkan kembali.

Saat salju mulai mencair dan musim semi semakin dekat, Senkuu dan teman-temannya di Desa Ishigami sedang menyelesaikan persiapan untuk serangan mereka terhadap Kekaisaran Tsukasa. Dengan model ponsel yang baru saja diperbarui, Kerajaan Sains siap untuk meluncurkan rencana terbaru mereka, yang bertujuan merekrut banyak tentara Tsukasa untuk bergabung dengan mereka. Namun, mereka sedang berlomba melawan waktu; setiap hari yang dihabiskan Kerajaan Sains untuk menyempurnakan penemuan mereka, kekaisaran itu semakin cepat berkembang dalam jumlah.

Bertemu kembali dengan teman-teman lama dan mendapatkan sekutu baru, Senkuu dan Kerajaan Sains kini harus berjuang melawan pasukan Tsukasa untuk mencapai tujuan mereka: mengembalikan umat manusia dan semua ciptaannya. Dengan kedua belah pihak berusaha meraih dunia ideal mereka, Perang Batu pun telah dimulai!

Pelajari lebih lanjut tentang Dr. Stone: Stone Wars.